Situé dans l'Académie de Dijon (zone A), le département de l'Yonne compte 641 établissements dans lesquels sont scolarisés plus de 33 000 élèves. Il dispose également de 29 établissements d'enseignement professionel et post-bac.
Établissements primaires et secondaires :
Établissements professionels et supérieurs :