Situé dans l'Académie de Besançon (zone A), le département du Jura compte 511 établissements dans lesquels sont scolarisés plus de 26 000 élèves. Il dispose également de 26 établissements d'enseignement professionel et post-bac.
Établissements primaires et secondaires :
Établissements professionels et supérieurs :